عرض مصدر تنوع النوكليوتيد

'''تنوع النوكليوتيد''' {{إنج|Nucleotide diversity}} هو مصطلح في [[علم الوراثة]] الجزيئي، يستخدم لقياس درجة تعدد الأشكال لدى السكان.<ref>{{استشهاد بدورية محكمة
|عنوان=Molecular diversity at 18 loci in 321 wild and 92 domesticate lines reveal no reduction of nucleotide diversity during Triticum monococcum (Einkorn) domestication: implications for the origin of agriculture
|صحيفة=Molecular Biology and Evolution
|تاريخ=December 2007
|الأول=
|الأخير= |مؤلف2=Ozkan H |مؤلف3=Walther A |مؤلف4=Kohl J |مؤلف5=Dagan T |مؤلف6=Salamini F |مؤلف7=Martin W
|المجلد=24
|العدد=12
|صفحات=2657–68
|pmid=17898361
|مسار=https://archive.org/details/sim_molecular-biology-and-evolution_2007-12_24_12/page/2657|doi=10.1093/molbev/msm192
|مؤلف=Kilian, B}}</ref><ref>{{استشهاد بدورية محكمة
|عنوان=Nucleotide diversity in gorillas
|صحيفة=Genetics
|تاريخ=March 2004
|الأول=
|الأخير= |مؤلف2=Jensen-Seaman MI |مؤلف3=Chemnick L |مؤلف4=Ryder O |مؤلف5=Li WH
|المجلد=166
|العدد=3
|صفحات=1375–83
|pmid=15082556 |pmc=1470796 |doi= 10.1534/genetics.166.3.1375|مسار= https://www.genetics.org/content/166/3/1375.long
|مؤلف=Yu, N.|مسار أرشيف= https://web.archive.org/web/20191215101925/http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15082556|تاريخ أرشيف=2019-12-15}}</ref><ref>{{استشهاد بدورية محكمة
|عنوان=Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endonucleases
|صحيفة=PNAS
|تاريخ=October 1, 1979
|الأول=
|الأخير= |مؤلف2=Masatoshi Nei |مؤلف3=Wen-Hsiung Li
|المجلد=76
|العدد=10
|صفحات=5269–73
|pmid=291943 |pmc=413122 
|مسار=
|doi=10.1073/pnas.76.10.5269
|مؤلف=Nei, M.}}</ref>

في سنة 1979، قام ني و[[وين شيونغ لي]]، باقتراح أول مقياس يستخدم في قياس هذا التنوع، ويتم تعريف هذا الإجراء بأنه متوسط عدد اختلافات (فروقات) النوكليوتيدات، لكل موقع يوجد بين أي اثنين من سلاسل الحمض النووي تم اختيارها عشوائيا من عينة السكان، ويرمز لها ب π.

يمثل الرمز الأول والثاني التكرارات على التتابع، ويمثل n اختلافات (فروقات) [[نوكليوتيد|النوكليوتيدات]] لكل موقع يوجد بين أي اثنين من سلاسل الحمض النووي، ويتم إجراء الجمع على كل [[زواج|الأزواج]] المنفصلة دون تكرار.

يتم إعطاؤه بالصيغة:

: <math>\pi = \sum_{ij} x_i x_j \pi_{ij} = 2 * \sum_{i=2}^n \sum_{j=1}^{i-1} x_i x_j \pi_{ij}</math>

حيث <math>x_i</math> <math>x_j</math> هي ترددات كل من <math>i</math> و <math>j</math> تسلسل، <math>pi_{ij}</math> هو عدد اختلافات النيوكليوتيد لكل موقع نيوكليوتيد بين <math>i</math> th و <math>j</math> تسلسل، <math>n</math> هو عدد التسلسلات في العينة.

تنوع النوكليوتيدات، هو على قدر من الاختلاف الجيني. ويرتبط عادة مع المقاييس الإحصائية الأخرى لتنوع السكان، وهو مشابه لتغاير الزيجوت المتوقع. ويمكن حساب تنوع النكليوتيد، من خلال دراسة [[تسلسل الحمض النووي]] مباشرة، أو يمكن تقديره باستخدام بيانات العلامة الجزيئية، مثل مؤشرات المكاثرة العشوائية لقطع الـحامض النووي المتباينة، تقنية تعدد الأشكال الطولي للقطع المضخمة.
== البرامج ==
* [http://www.ub.es/dnasp/ DnaSP]تسلسل [[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين|الحمض النووي]] متعدد الأشكال، هو مجموعة من البرامج لتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات، الخاصة بانحياز لبيانات تسلسل الحمض النووي.
ميجا، وهو تحليل علم الوراثة الجزيئي التطوري، هو مجموعة من البرامج المستخدمة لتقدير معدلات التطور الجزيئي، فضلا عن توليد شجرة المَحْتِد، والتوفيق بين تسلسل الحمض النووي. يمكن استخدام هذا البرنامج على كل من نظامي تشغيل ا لويندوز ولينوكس.

* [http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3/ Arlequin3] ويمكن استخدام البرنامج لإجراء العمليات الحسابية لتنوع النوكليوتيدات، ومجموعة متنوعة من الاختبارات الإحصائية الأخرى، لما بين السكان، داخل السكان. متاح على نظام [[مايكروسوفت ويندوز|ويندوز]].

== مراجع ==
{{مراجع}}

{{بذرة علم الوراثة}}
{{شريط بوابات|علم الوراثة}}

[[تصنيف:علم الوراثة الجزيئي]]